De origine aromână, părinții lui Andrei Șaguna se trăgeau din Grabova, din Albania.
În 1833, se călugărește sub numele de Andrei, intrând în Ordinul Sfântul Vasile.
Urmează gimnaziul catolic (1826) la călugării piariști din Pesta; ulterior, între 1826-1829, a studiat filozofia și dreptul la Universitatea din Pesta. A studiat teologia la Vârșeț.
Lui i se datorează deschiderea unei tipografii, la Sibiu, în 1850, unde se tipăresc cărți în limba română. În 1853, întemeiază telegraful român. În 1855, organizează și restructurează învățământul teologic din Sibiu.